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研究人员发明出用于计算基因频率的新技术

2009/6/29/09:35 来源:成都商报

    慧聪制药工业网从指引干细胞的命运到决定我们能长多高,人们体内的基因作用于一个非常复杂的网络。而拆解这些相互作用则是一项艰苦而繁重的工作。如今,一个国际合作计划开发出的一种更为有效的综合处理方法有望加速这一研究进程。    

    研究人员发明出了一项技术,用于计算一种基因被表达的频率———在这一过程中,脱氧核糖核酸(DNA)被转录为核糖核酸(RNA),后者会依次编码一种蛋白质。而这些蛋白质中的大部分都能够影响其他基因的表达,进而最终增加或减少所形成的蛋白质的数量。在任何特定的时间,上百种基因会对其他基因的活性构成影响。但这一过程是相当复杂的。    

    通过用新的软件对这些海量数据进行筛选,研究小组梳理出了重要的角色以及它们之间的关系。这项研究的第一个目标便是与THP-1细胞———在实验室实验中使用的一种人类白血病细胞系———的分化控制有关的调节网络。研究小组在基因组中鉴别出29857个能够对蛋白质调节作出响应的区域,并在分化过程中追踪了其中6例的活性水平。    

    最终的结果是一个鸟巢状的调节路径。这些路径通常被认为是分等级排列的,即在顶层的一个或少量“主基因”会形成一个影响的“小瀑布”,进而向下层的基因蔓延。   

    而另一种模型则恰恰相反———调节蛋白质会促进一种基因的表达,而在细胞到达一个新的平衡之前,另一种调节蛋白质则会抑制该基因,一个反馈回路随即产生。   

    分子遗传学家JuhaKere表示,这篇新的论文“是迄今为止对于一个细胞分化事件的最为完整的研究结果”。日本东京医学与牙齿大学的生物信息学家HiroshiTanaka表示,对于网络如何活动的更为透彻的了解使得科学家能够制造出新的细胞类型。

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